Las sanciones impuestas por la Comisión Disciplinaria de la FEF en esta temporada han afectado a cinco clubes de la LigaPro, quienes han padecido la resta de puntos, castigos que en su mayoría se han dado por deudas con técnicos, jugadores y demás, mismas que no han sido cumplidas a tiempo.
Estos son los clubes que han sido sancionados en esta temporada:
- Libertad (-4 puntos)
- El Nacional (-3 puntos)
- Emelec (-3 puntos)
- Deportivo Cuenca (-3 puntos)
- Liga de Quito (-3 puntos)